中国农业科学院科研人员开发出首款茶树高密度 SNP 芯片

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2021-12-22 电脑百科网

12 月 21 日音讯,近日,中国农业科学院茶叶研讨所茶树遗传育种团队根据“龙井 43”基因组参阅序列和茶树重测序数据,开发出一款 200K 茶树 SNP 芯片。相关研讨成果在《植物生物技术杂志(Plant Biotechnology Journal)》上宣布。

该芯片是首款茶树高密度 SNP 芯片,以“龙井 43”(雌性)和“白毫早”(雄性)F1 集体为材料,该芯片可以将 18226 个 SNP 位点绘入图谱,获得 5325 个 bin-marker,连锁图谱总长度为 2107.01 厘摩,相邻符号平均遗传图距为 0.39 厘摩,构建了目前遗传密度最高的连锁图谱。

开掘茶树重要功能基因

试验验证表明,该芯片可以有效定位要害 QTL 位点,开掘茶树重要功能基因。利用其对不同茶树种类的 SNP 分型研讨,发现茶树大叶种和小叶种之间的两个强挑选位点,对揭示茶树品质调控要害基因和两个变种间的进化联系具有重要意义。

据悉,该研讨得到国家重点研发项目、中国农科院科技创新工程、国家自然科学基金等项目的支持。

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